Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRDTQ58F21 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRDTQ58F21 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRDTQ58F21 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRDTQ58F21 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRDTQ58F21 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRDTQ58F21 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRDTQ58F21 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRDTQ58F21 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRDTQ58F21 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BRDTQ58F21 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRDTQ58F21 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRDTQ58F21 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
BRDTQ58F21 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
BRDTQ58F21 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRDTQ58F21 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRDTQ58F21 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRDTQ58F21 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
BRDTQ58F21 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRDTQ58F21 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRDTQ58F21 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRDTQ58F21 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BRDTQ58F21 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
BRDTQ58F21 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BRDTQ58F21 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRDTQ58F21 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRDTQ58F21 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRDTQ58F21 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRDTQ58F21 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRDTQ58F21 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRDTQ58F21 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRDTQ58F21 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BRDTQ58F21 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BRDTQ58F21 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRDTQ58F21 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRDTQ58F21 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRDTQ58F21 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRDTQ58F21 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRDTQ58F21 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRDTQ58F21 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRDTQ58F21 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
BRDTQ58F21 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
BRDTQ58F21 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRDTQ58F21 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRDTQ58F21 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRDTQ58F21 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRDTQ58F21 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRDTQ58F21 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRDTQ58F21 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRDTQ58F21 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRDTQ58F21 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
BRDTQ58F21 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRDTQ58F21 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRDTQ58F21 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRDTQ58F21 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRDTQ58F21 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
BRDTQ58F21 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRDTQ58F21 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRDTQ58F21 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
BRDTQ58F21 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRDTQ58F21 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRDTQ58F21 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRDTQ58F21 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRDTQ58F21 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRDTQ58F21 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRDTQ58F21 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRDTQ58F21 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRDTQ58F21 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRDTQ58F21 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRDTQ58F21 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRDTQ58F21 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
BRDTQ58F21 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRDTQ58F21 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRDTQ58F21 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRDTQ58F21 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRDTQ58F21 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRDTQ58F21 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
BRDTQ58F21 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRDTQ58F21 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRDTQ58F21 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
BRDTQ58F21 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRDTQ58F21 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRDTQ58F21 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRDTQ58F21 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRDTQ58F21 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRDTQ58F21 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRDTQ58F21 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRDTQ58F21 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRDTQ58F21 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BRDTQ58F21 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BRDTQ58F21 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BRDTQ58F21 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BRDTQ58F21 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRDTQ58F21 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRDTQ58F21 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRDTQ58F21 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRDTQ58F21 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRDTQ58F21 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRDTQ58F21 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRDTQ58F21 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms