Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBRG1Q3YBR2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBRG1Q3YBR2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TBRG1Q3YBR2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBRG1Q3YBR2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBRG1Q3YBR2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBRG1Q3YBR2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBRG1Q3YBR2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBRG1Q3YBR2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBRG1Q3YBR2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBRG1Q3YBR2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBRG1Q3YBR2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBRG1Q3YBR2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBRG1Q3YBR2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBRG1Q3YBR2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBRG1Q3YBR2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TBRG1Q3YBR2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBRG1Q3YBR2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBRG1Q3YBR2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBRG1Q3YBR2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBRG1Q3YBR2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TBRG1Q3YBR2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms