Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTLL9Q3SXZ7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL9Q3SXZ7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL9Q3SXZ7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL9Q3SXZ7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL9Q3SXZ7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL9Q3SXZ7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL9Q3SXZ7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL9Q3SXZ7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL9Q3SXZ7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL9Q3SXZ7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL9Q3SXZ7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL9Q3SXZ7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL9Q3SXZ7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL9Q3SXZ7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL9Q3SXZ7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL9Q3SXZ7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL9Q3SXZ7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL9Q3SXZ7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL9Q3SXZ7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL9Q3SXZ7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL9Q3SXZ7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL9Q3SXZ7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTLL9Q3SXZ7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL9Q3SXZ7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL9Q3SXZ7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL9Q3SXZ7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL9Q3SXZ7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL9Q3SXZ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL9Q3SXZ7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL9Q3SXZ7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL9Q3SXZ7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL9Q3SXZ7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL9Q3SXZ7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL9Q3SXZ7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms