Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP20-2Q3LI61 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
KRTAP20-2Q3LI61 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP20-2Q3LI61 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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