Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-BQ31612 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-BQ31612 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-BQ31612 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-BQ31612 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-BQ31612 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-BQ31612 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-BQ31612 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-BQ31612 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-BQ31612 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-BQ31612 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-BQ31612 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-BQ31612 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-BQ31612 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-BQ31612 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-BQ31612 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-BQ31612 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-BQ31612 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-BQ31612 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-BQ31612 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-BQ31612 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-BQ31612 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-BQ31612 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-BQ31612 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-BQ31612 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-BQ31612 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-BQ31612 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-BQ31612 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-BQ31612 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-BQ31612 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-BQ31612 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-BQ31612 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-BQ31612 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-BQ31612 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-BQ31612 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-BQ31612 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-BQ31612 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-BQ31612 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-BQ31612 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-BQ31612 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-BQ31612 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-BQ31612 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-BQ31612 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-BQ31612 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-BQ31612 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-BQ31612 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-BQ31612 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-BQ31612 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-BQ31612 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-BQ31612 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-BQ31612 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-BQ31612 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-BQ31612 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-BQ31612 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-BQ31612 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-BQ31612 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
HLA-BQ31612 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-BQ31612 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-BQ31612 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-BQ31612 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-BQ31612 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-BQ31612 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-BQ31612 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-BQ31612 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-BQ31612 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-BQ31612 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-BQ31612 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-BQ31612 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-BQ31612 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-BQ31612 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-BQ31612 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-BQ31612 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-BQ31612 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-BQ31612 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-BQ31612 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-BQ31612 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-BQ31612 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-BQ31612 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-BQ31612 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLA-BQ31612 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLA-BQ31612 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HLA-BQ31612 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLA-BQ31612 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HLA-BQ31612 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HLA-BQ31612 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-BQ31612 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-BQ31612 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-BQ31612 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-BQ31612 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-BQ31612 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-BQ31612 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-BQ31612 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-BQ31612 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-BQ31612 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-BQ31612 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-BQ31612 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-BQ31612 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-BQ31612 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-BQ31612 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-BQ31612 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms