Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SKIDA1Q1XH10 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SKIDA1Q1XH10 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SKIDA1Q1XH10 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SKIDA1Q1XH10 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKIDA1Q1XH10 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKIDA1Q1XH10 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKIDA1Q1XH10 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SKIDA1Q1XH10 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SKIDA1Q1XH10 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SKIDA1Q1XH10 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SKIDA1Q1XH10 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SKIDA1Q1XH10 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKIDA1Q1XH10 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKIDA1Q1XH10 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKIDA1Q1XH10 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKIDA1Q1XH10 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKIDA1Q1XH10 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SKIDA1Q1XH10 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SKIDA1Q1XH10 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKIDA1Q1XH10 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKIDA1Q1XH10 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKIDA1Q1XH10 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SKIDA1Q1XH10 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKIDA1Q1XH10 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKIDA1Q1XH10 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKIDA1Q1XH10 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKIDA1Q1XH10 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKIDA1Q1XH10 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKIDA1Q1XH10 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKIDA1Q1XH10 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKIDA1Q1XH10 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKIDA1Q1XH10 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKIDA1Q1XH10 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKIDA1Q1XH10 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKIDA1Q1XH10 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKIDA1Q1XH10 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKIDA1Q1XH10 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKIDA1Q1XH10 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKIDA1Q1XH10 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKIDA1Q1XH10 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKIDA1Q1XH10 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SKIDA1Q1XH10 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKIDA1Q1XH10 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKIDA1Q1XH10 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKIDA1Q1XH10 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SKIDA1Q1XH10 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SKIDA1Q1XH10 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKIDA1Q1XH10 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKIDA1Q1XH10 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SKIDA1Q1XH10 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SKIDA1Q1XH10 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SKIDA1Q1XH10 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SKIDA1Q1XH10 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SKIDA1Q1XH10 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SKIDA1Q1XH10 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SKIDA1Q1XH10 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SKIDA1Q1XH10 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKIDA1Q1XH10 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKIDA1Q1XH10 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKIDA1Q1XH10 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKIDA1Q1XH10 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKIDA1Q1XH10 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKIDA1Q1XH10 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKIDA1Q1XH10 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKIDA1Q1XH10 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKIDA1Q1XH10 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKIDA1Q1XH10 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms