Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF9Q16594 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF9Q16594 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF9Q16594 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF9Q16594 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF9Q16594 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF9Q16594 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF9Q16594 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF9Q16594 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF9Q16594 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF9Q16594 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF9Q16594 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF9Q16594 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF9Q16594 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF9Q16594 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF9Q16594 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF9Q16594 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF9Q16594 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF9Q16594 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF9Q16594 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF9Q16594 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF9Q16594 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF9Q16594 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF9Q16594 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF9Q16594 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF9Q16594 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF9Q16594 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF9Q16594 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF9Q16594 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF9Q16594 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF9Q16594 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF9Q16594 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF9Q16594 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF9Q16594 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF9Q16594 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF9Q16594 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF9Q16594 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF9Q16594 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms