Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMD5Q16401 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMD5Q16401 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMD5Q16401 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMD5Q16401 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMD5Q16401 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMD5Q16401 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMD5Q16401 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMD5Q16401 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMD5Q16401 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMD5Q16401 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMD5Q16401 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMD5Q16401 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSMD5Q16401 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMD5Q16401 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMD5Q16401 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMD5Q16401 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMD5Q16401 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMD5Q16401 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMD5Q16401 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMD5Q16401 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMD5Q16401 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMD5Q16401 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMD5Q16401 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMD5Q16401 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMD5Q16401 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMD5Q16401 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMD5Q16401 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMD5Q16401 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMD5Q16401 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMD5Q16401 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMD5Q16401 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMD5Q16401 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMD5Q16401 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMD5Q16401 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMD5Q16401 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMD5Q16401 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMD5Q16401 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMD5Q16401 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMD5Q16401 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD5Q16401 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD5Q16401 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD5Q16401 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD5Q16401 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD5Q16401 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD5Q16401 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMD5Q16401 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMD5Q16401 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMD5Q16401 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMD5Q16401 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMD5Q16401 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMD5Q16401 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMD5Q16401 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMD5Q16401 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMD5Q16401 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMD5Q16401 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMD5Q16401 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMD5Q16401 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMD5Q16401 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMD5Q16401 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMD5Q16401 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMD5Q16401 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMD5Q16401 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMD5Q16401 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMD5Q16401 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMD5Q16401 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMD5Q16401 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMD5Q16401 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMD5Q16401 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMD5Q16401 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMD5Q16401 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMD5Q16401 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMD5Q16401 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMD5Q16401 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMD5Q16401 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMD5Q16401 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMD5Q16401 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMD5Q16401 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMD5Q16401 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMD5Q16401 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMD5Q16401 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMD5Q16401 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMD5Q16401 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMD5Q16401 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMD5Q16401 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMD5Q16401 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMD5Q16401 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMD5Q16401 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMD5Q16401 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMD5Q16401 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMD5Q16401 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMD5Q16401 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMD5Q16401 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMD5Q16401 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMD5Q16401 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMD5Q16401 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMD5Q16401 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMD5Q16401 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMD5Q16401 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMD5Q16401 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms