Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NTRK3Q16288 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NTRK3Q16288 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NTRK3Q16288 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NTRK3Q16288 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NTRK3Q16288 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NTRK3Q16288 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NTRK3Q16288 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NTRK3Q16288 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NTRK3Q16288 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NTRK3Q16288 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NTRK3Q16288 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NTRK3Q16288 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NTRK3Q16288 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NTRK3Q16288 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NTRK3Q16288 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NTRK3Q16288 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NTRK3Q16288 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NTRK3Q16288 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NTRK3Q16288 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NTRK3Q16288 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NTRK3Q16288 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NTRK3Q16288 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NTRK3Q16288 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NTRK3Q16288 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NTRK3Q16288 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NTRK3Q16288 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NTRK3Q16288 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NTRK3Q16288 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NTRK3Q16288 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NTRK3Q16288 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NTRK3Q16288 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NTRK3Q16288 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NTRK3Q16288 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NTRK3Q16288 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NTRK3Q16288 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NTRK3Q16288 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NTRK3Q16288 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NTRK3Q16288 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NTRK3Q16288 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NTRK3Q16288 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NTRK3Q16288 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NTRK3Q16288 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NTRK3Q16288 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NTRK3Q16288 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NTRK3Q16288 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NTRK3Q16288 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NTRK3Q16288 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NTRK3Q16288 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NTRK3Q16288 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NTRK3Q16288 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NTRK3Q16288 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NTRK3Q16288 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NTRK3Q16288 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NTRK3Q16288 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NTRK3Q16288 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NTRK3Q16288 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NTRK3Q16288 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NTRK3Q16288 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NTRK3Q16288 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NTRK3Q16288 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NTRK3Q16288 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NTRK3Q16288 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NTRK3Q16288 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NTRK3Q16288 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NTRK3Q16288 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NTRK3Q16288 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NTRK3Q16288 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NTRK3Q16288 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NTRK3Q16288 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NTRK3Q16288 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NTRK3Q16288 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NTRK3Q16288 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NTRK3Q16288 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
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