Protein–RNA interactions for Protein: Q15319

POU4F3, POU domain, class 4, transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU4F3Q15319 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POU4F3Q15319 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POU4F3Q15319 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POU4F3Q15319 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POU4F3Q15319 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POU4F3Q15319 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POU4F3Q15319 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POU4F3Q15319 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POU4F3Q15319 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POU4F3Q15319 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POU4F3Q15319 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POU4F3Q15319 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POU4F3Q15319 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POU4F3Q15319 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POU4F3Q15319 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POU4F3Q15319 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POU4F3Q15319 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POU4F3Q15319 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POU4F3Q15319 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POU4F3Q15319 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POU4F3Q15319 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POU4F3Q15319 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POU4F3Q15319 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POU4F3Q15319 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POU4F3Q15319 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POU4F3Q15319 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POU4F3Q15319 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POU4F3Q15319 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POU4F3Q15319 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POU4F3Q15319 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POU4F3Q15319 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POU4F3Q15319 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POU4F3Q15319 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POU4F3Q15319 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POU4F3Q15319 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POU4F3Q15319 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POU4F3Q15319 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POU4F3Q15319 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POU4F3Q15319 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POU4F3Q15319 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POU4F3Q15319 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms