Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
GAPVD1Q14C86 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
GAPVD1Q14C86 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
GAPVD1Q14C86 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
GAPVD1Q14C86 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
GAPVD1Q14C86 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.52
GAPVD1Q14C86 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
GAPVD1Q14C86 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
GAPVD1Q14C86 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
GAPVD1Q14C86 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
GAPVD1Q14C86 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
GAPVD1Q14C86 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
GAPVD1Q14C86 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
GAPVD1Q14C86 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
GAPVD1Q14C86 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
GAPVD1Q14C86 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC43.28■■■■■ 4.52
GAPVD1Q14C86 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC43.28■■■■■ 4.52
GAPVD1Q14C86 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
GAPVD1Q14C86 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
GAPVD1Q14C86 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
GAPVD1Q14C86 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
GAPVD1Q14C86 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
GAPVD1Q14C86 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
GAPVD1Q14C86 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC43.25■■■■■ 4.51
GAPVD1Q14C86 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
GAPVD1Q14C86 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
GAPVD1Q14C86 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
GAPVD1Q14C86 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC43.23■■■■■ 4.51
GAPVD1Q14C86 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC43.23■■■■■ 4.51
GAPVD1Q14C86 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
GAPVD1Q14C86 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC43.21■■■■■ 4.51
GAPVD1Q14C86 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
GAPVD1Q14C86 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
GAPVD1Q14C86 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
GAPVD1Q14C86 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
GAPVD1Q14C86 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
GAPVD1Q14C86 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
GAPVD1Q14C86 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
GAPVD1Q14C86 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
GAPVD1Q14C86 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
GAPVD1Q14C86 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
GAPVD1Q14C86 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
GAPVD1Q14C86 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
GAPVD1Q14C86 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
GAPVD1Q14C86 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.49
GAPVD1Q14C86 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
GAPVD1Q14C86 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
GAPVD1Q14C86 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
GAPVD1Q14C86 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
GAPVD1Q14C86 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
GAPVD1Q14C86 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
GAPVD1Q14C86 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
GAPVD1Q14C86 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
GAPVD1Q14C86 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
GAPVD1Q14C86 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC43.07■■■■■ 4.49
GAPVD1Q14C86 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
GAPVD1Q14C86 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC43.07■■■■■ 4.48
GAPVD1Q14C86 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
GAPVD1Q14C86 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
GAPVD1Q14C86 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.04■■■■■ 4.48
GAPVD1Q14C86 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
GAPVD1Q14C86 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
GAPVD1Q14C86 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC43.01■■■■■ 4.48
GAPVD1Q14C86 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
GAPVD1Q14C86 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
GAPVD1Q14C86 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
GAPVD1Q14C86 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
GAPVD1Q14C86 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
GAPVD1Q14C86 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
GAPVD1Q14C86 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
GAPVD1Q14C86 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
GAPVD1Q14C86 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
GAPVD1Q14C86 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
GAPVD1Q14C86 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
GAPVD1Q14C86 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
GAPVD1Q14C86 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
GAPVD1Q14C86 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
GAPVD1Q14C86 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
GAPVD1Q14C86 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
GAPVD1Q14C86 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
GAPVD1Q14C86 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
GAPVD1Q14C86 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC42.95■■■■■ 4.47
GAPVD1Q14C86 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.47
GAPVD1Q14C86 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC42.94■■■■■ 4.46
GAPVD1Q14C86 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
GAPVD1Q14C86 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
GAPVD1Q14C86 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
GAPVD1Q14C86 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
GAPVD1Q14C86 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
GAPVD1Q14C86 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
GAPVD1Q14C86 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC42.89■■■■■ 4.46
GAPVD1Q14C86 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
GAPVD1Q14C86 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
GAPVD1Q14C86 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
GAPVD1Q14C86 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
GAPVD1Q14C86 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
GAPVD1Q14C86 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
GAPVD1Q14C86 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
GAPVD1Q14C86 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
GAPVD1Q14C86 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
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