Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

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Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PSME4Q14997 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
PSME4Q14997 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PSME4Q14997 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PSME4Q14997 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PSME4Q14997 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PSME4Q14997 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PSME4Q14997 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PSME4Q14997 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PSME4Q14997 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
PSME4Q14997 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PSME4Q14997 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PSME4Q14997 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PSME4Q14997 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PSME4Q14997 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PSME4Q14997 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
PSME4Q14997 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PSME4Q14997 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PSME4Q14997 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSME4Q14997 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSME4Q14997 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
PSME4Q14997 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSME4Q14997 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSME4Q14997 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PSME4Q14997 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PSME4Q14997 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PSME4Q14997 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PSME4Q14997 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PSME4Q14997 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PSME4Q14997 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PSME4Q14997 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PSME4Q14997 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PSME4Q14997 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PSME4Q14997 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PSME4Q14997 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
PSME4Q14997 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PSME4Q14997 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PSME4Q14997 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PSME4Q14997 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PSME4Q14997 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PSME4Q14997 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PSME4Q14997 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PSME4Q14997 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PSME4Q14997 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PSME4Q14997 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PSME4Q14997 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PSME4Q14997 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PSME4Q14997 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PSME4Q14997 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PSME4Q14997 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PSME4Q14997 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PSME4Q14997 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PSME4Q14997 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PSME4Q14997 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PSME4Q14997 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PSME4Q14997 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PSME4Q14997 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PSME4Q14997 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
PSME4Q14997 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PSME4Q14997 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PSME4Q14997 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PSME4Q14997 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
PSME4Q14997 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PSME4Q14997 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
PSME4Q14997 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PSME4Q14997 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PSME4Q14997 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
PSME4Q14997 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PSME4Q14997 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PSME4Q14997 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PSME4Q14997 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PSME4Q14997 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PSME4Q14997 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PSME4Q14997 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
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