Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
BECN1Q14457 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
BECN1Q14457 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
BECN1Q14457 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
BECN1Q14457 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
BECN1Q14457 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
BECN1Q14457 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
BECN1Q14457 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
BECN1Q14457 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
BECN1Q14457 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
BECN1Q14457 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
BECN1Q14457 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
BECN1Q14457 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
BECN1Q14457 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
BECN1Q14457 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
BECN1Q14457 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
BECN1Q14457 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
BECN1Q14457 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
BECN1Q14457 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BECN1Q14457 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BECN1Q14457 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BECN1Q14457 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
BECN1Q14457 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BECN1Q14457 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BECN1Q14457 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BECN1Q14457 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
BECN1Q14457 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
BECN1Q14457 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
BECN1Q14457 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
BECN1Q14457 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
BECN1Q14457 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
BECN1Q14457 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
BECN1Q14457 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BECN1Q14457 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
BECN1Q14457 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
BECN1Q14457 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BECN1Q14457 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
BECN1Q14457 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
BECN1Q14457 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BECN1Q14457 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
BECN1Q14457 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BECN1Q14457 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
BECN1Q14457 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BECN1Q14457 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
BECN1Q14457 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
BECN1Q14457 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
BECN1Q14457 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
BECN1Q14457 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BECN1Q14457 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BECN1Q14457 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
BECN1Q14457 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
BECN1Q14457 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
BECN1Q14457 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BECN1Q14457 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
BECN1Q14457 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
BECN1Q14457 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
BECN1Q14457 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
BECN1Q14457 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
BECN1Q14457 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BECN1Q14457 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
BECN1Q14457 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BECN1Q14457 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BECN1Q14457 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
BECN1Q14457 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BECN1Q14457 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
BECN1Q14457 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
BECN1Q14457 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BECN1Q14457 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BECN1Q14457 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BECN1Q14457 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BECN1Q14457 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BECN1Q14457 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
BECN1Q14457 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
BECN1Q14457 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
BECN1Q14457 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
BECN1Q14457 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
BECN1Q14457 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
BECN1Q14457 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
BECN1Q14457 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
BECN1Q14457 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
BECN1Q14457 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
BECN1Q14457 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
BECN1Q14457 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BECN1Q14457 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
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