Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPIDRQ14159 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPIDRQ14159 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPIDRQ14159 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPIDRQ14159 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPIDRQ14159 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPIDRQ14159 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPIDRQ14159 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPIDRQ14159 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPIDRQ14159 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPIDRQ14159 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPIDRQ14159 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPIDRQ14159 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPIDRQ14159 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPIDRQ14159 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPIDRQ14159 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPIDRQ14159 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPIDRQ14159 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPIDRQ14159 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPIDRQ14159 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPIDRQ14159 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPIDRQ14159 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPIDRQ14159 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPIDRQ14159 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIDRQ14159 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIDRQ14159 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIDRQ14159 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIDRQ14159 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIDRQ14159 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIDRQ14159 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIDRQ14159 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIDRQ14159 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIDRQ14159 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIDRQ14159 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIDRQ14159 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIDRQ14159 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SPIDRQ14159 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIDRQ14159 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIDRQ14159 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIDRQ14159 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIDRQ14159 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIDRQ14159 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIDRQ14159 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIDRQ14159 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIDRQ14159 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIDRQ14159 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIDRQ14159 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIDRQ14159 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIDRQ14159 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIDRQ14159 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIDRQ14159 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIDRQ14159 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIDRQ14159 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIDRQ14159 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIDRQ14159 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIDRQ14159 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPIDRQ14159 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPIDRQ14159 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPIDRQ14159 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIDRQ14159 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIDRQ14159 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIDRQ14159 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIDRQ14159 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIDRQ14159 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIDRQ14159 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIDRQ14159 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIDRQ14159 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIDRQ14159 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIDRQ14159 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
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