Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNX2Q13950 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNX2Q13950 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNX2Q13950 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNX2Q13950 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNX2Q13950 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNX2Q13950 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNX2Q13950 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNX2Q13950 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNX2Q13950 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNX2Q13950 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNX2Q13950 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNX2Q13950 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNX2Q13950 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNX2Q13950 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNX2Q13950 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNX2Q13950 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNX2Q13950 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNX2Q13950 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNX2Q13950 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNX2Q13950 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNX2Q13950 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNX2Q13950 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNX2Q13950 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNX2Q13950 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNX2Q13950 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNX2Q13950 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNX2Q13950 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNX2Q13950 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNX2Q13950 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNX2Q13950 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNX2Q13950 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNX2Q13950 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNX2Q13950 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNX2Q13950 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNX2Q13950 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNX2Q13950 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNX2Q13950 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNX2Q13950 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNX2Q13950 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNX2Q13950 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNX2Q13950 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNX2Q13950 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNX2Q13950 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNX2Q13950 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNX2Q13950 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNX2Q13950 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNX2Q13950 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNX2Q13950 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNX2Q13950 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNX2Q13950 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNX2Q13950 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNX2Q13950 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNX2Q13950 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNX2Q13950 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNX2Q13950 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNX2Q13950 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RUNX2Q13950 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNX2Q13950 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNX2Q13950 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNX2Q13950 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNX2Q13950 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNX2Q13950 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNX2Q13950 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNX2Q13950 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNX2Q13950 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNX2Q13950 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNX2Q13950 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNX2Q13950 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNX2Q13950 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNX2Q13950 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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