Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNFAIP1Q13829 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNFAIP1Q13829 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNFAIP1Q13829 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNFAIP1Q13829 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
TNFAIP1Q13829 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TNFAIP1Q13829 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TNFAIP1Q13829 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNFAIP1Q13829 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNFAIP1Q13829 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNFAIP1Q13829 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNFAIP1Q13829 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
TNFAIP1Q13829 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNFAIP1Q13829 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNFAIP1Q13829 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNFAIP1Q13829 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNFAIP1Q13829 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNFAIP1Q13829 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNFAIP1Q13829 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNFAIP1Q13829 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNFAIP1Q13829 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNFAIP1Q13829 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNFAIP1Q13829 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNFAIP1Q13829 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNFAIP1Q13829 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TNFAIP1Q13829 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TNFAIP1Q13829 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TNFAIP1Q13829 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
TNFAIP1Q13829 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
TNFAIP1Q13829 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
TNFAIP1Q13829 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
TNFAIP1Q13829 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TNFAIP1Q13829 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TNFAIP1Q13829 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TNFAIP1Q13829 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TNFAIP1Q13829 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TNFAIP1Q13829 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TNFAIP1Q13829 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
TNFAIP1Q13829 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TNFAIP1Q13829 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TNFAIP1Q13829 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TNFAIP1Q13829 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TNFAIP1Q13829 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TNFAIP1Q13829 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TNFAIP1Q13829 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TNFAIP1Q13829 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TNFAIP1Q13829 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TNFAIP1Q13829 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TNFAIP1Q13829 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TNFAIP1Q13829 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TNFAIP1Q13829 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
TNFAIP1Q13829 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TNFAIP1Q13829 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TNFAIP1Q13829 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TNFAIP1Q13829 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TNFAIP1Q13829 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
TNFAIP1Q13829 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TNFAIP1Q13829 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TNFAIP1Q13829 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TNFAIP1Q13829 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TNFAIP1Q13829 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TNFAIP1Q13829 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TNFAIP1Q13829 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNFAIP1Q13829 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNFAIP1Q13829 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNFAIP1Q13829 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNFAIP1Q13829 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
TNFAIP1Q13829 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNFAIP1Q13829 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNFAIP1Q13829 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNFAIP1Q13829 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNFAIP1Q13829 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
TNFAIP1Q13829 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TNFAIP1Q13829 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TNFAIP1Q13829 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TNFAIP1Q13829 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TNFAIP1Q13829 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TNFAIP1Q13829 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
TNFAIP1Q13829 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TNFAIP1Q13829 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TNFAIP1Q13829 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNFAIP1Q13829 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNFAIP1Q13829 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNFAIP1Q13829 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNFAIP1Q13829 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNFAIP1Q13829 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNFAIP1Q13829 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNFAIP1Q13829 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNFAIP1Q13829 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNFAIP1Q13829 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNFAIP1Q13829 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNFAIP1Q13829 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TNFAIP1Q13829 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNFAIP1Q13829 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNFAIP1Q13829 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNFAIP1Q13829 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNFAIP1Q13829 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNFAIP1Q13829 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNFAIP1Q13829 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNFAIP1Q13829 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
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