Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB3Q13751 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB3Q13751 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB3Q13751 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB3Q13751 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB3Q13751 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMB3Q13751 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMB3Q13751 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMB3Q13751 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMB3Q13751 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMB3Q13751 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMB3Q13751 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMB3Q13751 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMB3Q13751 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMB3Q13751 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMB3Q13751 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMB3Q13751 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMB3Q13751 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMB3Q13751 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMB3Q13751 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMB3Q13751 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMB3Q13751 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMB3Q13751 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMB3Q13751 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMB3Q13751 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMB3Q13751 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMB3Q13751 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMB3Q13751 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMB3Q13751 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMB3Q13751 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMB3Q13751 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMB3Q13751 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMB3Q13751 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMB3Q13751 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMB3Q13751 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMB3Q13751 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMB3Q13751 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMB3Q13751 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMB3Q13751 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMB3Q13751 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMB3Q13751 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMB3Q13751 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMB3Q13751 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMB3Q13751 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMB3Q13751 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
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