Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGA7Q13683 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGA7Q13683 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGA7Q13683 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGA7Q13683 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGA7Q13683 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGA7Q13683 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGA7Q13683 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGA7Q13683 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGA7Q13683 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGA7Q13683 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGA7Q13683 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
ITGA7Q13683 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGA7Q13683 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGA7Q13683 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGA7Q13683 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGA7Q13683 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGA7Q13683 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGA7Q13683 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGA7Q13683 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGA7Q13683 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGA7Q13683 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGA7Q13683 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGA7Q13683 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGA7Q13683 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGA7Q13683 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGA7Q13683 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGA7Q13683 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGA7Q13683 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGA7Q13683 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGA7Q13683 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGA7Q13683 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGA7Q13683 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGA7Q13683 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGA7Q13683 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGA7Q13683 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGA7Q13683 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGA7Q13683 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGA7Q13683 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGA7Q13683 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ITGA7Q13683 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGA7Q13683 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGA7Q13683 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGA7Q13683 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGA7Q13683 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGA7Q13683 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGA7Q13683 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGA7Q13683 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGA7Q13683 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGA7Q13683 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGA7Q13683 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGA7Q13683 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGA7Q13683 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGA7Q13683 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGA7Q13683 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGA7Q13683 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
ITGA7Q13683 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGA7Q13683 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGA7Q13683 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGA7Q13683 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGA7Q13683 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGA7Q13683 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGA7Q13683 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGA7Q13683 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGA7Q13683 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGA7Q13683 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGA7Q13683 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGA7Q13683 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGA7Q13683 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGA7Q13683 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGA7Q13683 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGA7Q13683 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGA7Q13683 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGA7Q13683 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGA7Q13683 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGA7Q13683 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGA7Q13683 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGA7Q13683 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGA7Q13683 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGA7Q13683 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGA7Q13683 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGA7Q13683 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGA7Q13683 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGA7Q13683 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGA7Q13683 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGA7Q13683 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGA7Q13683 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGA7Q13683 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGA7Q13683 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGA7Q13683 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGA7Q13683 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGA7Q13683 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGA7Q13683 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGA7Q13683 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGA7Q13683 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGA7Q13683 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGA7Q13683 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGA7Q13683 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGA7Q13683 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGA7Q13683 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
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