Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NEUROD1Q13562 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NEUROD1Q13562 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NEUROD1Q13562 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NEUROD1Q13562 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NEUROD1Q13562 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NEUROD1Q13562 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
NEUROD1Q13562 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
NEUROD1Q13562 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NEUROD1Q13562 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NEUROD1Q13562 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NEUROD1Q13562 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
NEUROD1Q13562 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
NEUROD1Q13562 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
NEUROD1Q13562 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NEUROD1Q13562 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
NEUROD1Q13562 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
NEUROD1Q13562 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
NEUROD1Q13562 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NEUROD1Q13562 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NEUROD1Q13562 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
NEUROD1Q13562 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NEUROD1Q13562 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
NEUROD1Q13562 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NEUROD1Q13562 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NEUROD1Q13562 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
NEUROD1Q13562 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
NEUROD1Q13562 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
NEUROD1Q13562 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NEUROD1Q13562 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NEUROD1Q13562 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
NEUROD1Q13562 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
NEUROD1Q13562 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
NEUROD1Q13562 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
NEUROD1Q13562 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
NEUROD1Q13562 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NEUROD1Q13562 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NEUROD1Q13562 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
NEUROD1Q13562 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NEUROD1Q13562 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NEUROD1Q13562 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NEUROD1Q13562 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NEUROD1Q13562 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
NEUROD1Q13562 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
NEUROD1Q13562 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NEUROD1Q13562 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NEUROD1Q13562 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NEUROD1Q13562 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
NEUROD1Q13562 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.6
NEUROD1Q13562 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
NEUROD1Q13562 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NEUROD1Q13562 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NEUROD1Q13562 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NEUROD1Q13562 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NEUROD1Q13562 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NEUROD1Q13562 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NEUROD1Q13562 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NEUROD1Q13562 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NEUROD1Q13562 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NEUROD1Q13562 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NEUROD1Q13562 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NEUROD1Q13562 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NEUROD1Q13562 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
NEUROD1Q13562 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
NEUROD1Q13562 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NEUROD1Q13562 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NEUROD1Q13562 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
NEUROD1Q13562 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NEUROD1Q13562 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NEUROD1Q13562 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NEUROD1Q13562 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
NEUROD1Q13562 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
NEUROD1Q13562 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NEUROD1Q13562 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
NEUROD1Q13562 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
NEUROD1Q13562 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NEUROD1Q13562 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
NEUROD1Q13562 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.4■■■■□ 3.58
NEUROD1Q13562 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
NEUROD1Q13562 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NEUROD1Q13562 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NEUROD1Q13562 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.57
NEUROD1Q13562 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
NEUROD1Q13562 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
NEUROD1Q13562 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
NEUROD1Q13562 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NEUROD1Q13562 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NEUROD1Q13562 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NEUROD1Q13562 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NEUROD1Q13562 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NEUROD1Q13562 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NEUROD1Q13562 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NEUROD1Q13562 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NEUROD1Q13562 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
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