Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SP140Q13342 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SP140Q13342 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SP140Q13342 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SP140Q13342 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SP140Q13342 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP140Q13342 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP140Q13342 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP140Q13342 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP140Q13342 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP140Q13342 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP140Q13342 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP140Q13342 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP140Q13342 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP140Q13342 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP140Q13342 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP140Q13342 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP140Q13342 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP140Q13342 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SP140Q13342 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SP140Q13342 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SP140Q13342 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP140Q13342 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP140Q13342 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SP140Q13342 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP140Q13342 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP140Q13342 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP140Q13342 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP140Q13342 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP140Q13342 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP140Q13342 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP140Q13342 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP140Q13342 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SP140Q13342 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SP140Q13342 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SP140Q13342 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SP140Q13342 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SP140Q13342 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SP140Q13342 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SP140Q13342 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP140Q13342 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SP140Q13342 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP140Q13342 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP140Q13342 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP140Q13342 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SP140Q13342 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP140Q13342 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP140Q13342 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP140Q13342 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP140Q13342 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SP140Q13342 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SP140Q13342 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP140Q13342 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP140Q13342 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SP140Q13342 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP140Q13342 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SP140Q13342 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SP140Q13342 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SP140Q13342 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SP140Q13342 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SP140Q13342 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SP140Q13342 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP140Q13342 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP140Q13342 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP140Q13342 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP140Q13342 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP140Q13342 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP140Q13342 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP140Q13342 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP140Q13342 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP140Q13342 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP140Q13342 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SP140Q13342 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SP140Q13342 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SP140Q13342 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SP140Q13342 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SP140Q13342 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SP140Q13342 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SP140Q13342 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SP140Q13342 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SP140Q13342 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP140Q13342 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP140Q13342 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SP140Q13342 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SP140Q13342 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SP140Q13342 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SP140Q13342 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SP140Q13342 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP140Q13342 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP140Q13342 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP140Q13342 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP140Q13342 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP140Q13342 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SP140Q13342 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SP140Q13342 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP140Q13342 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP140Q13342 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP140Q13342 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP140Q13342 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP140Q13342 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms