Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SP140Q13342 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SP140Q13342 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SP140Q13342 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SP140Q13342 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SP140Q13342 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP140Q13342 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP140Q13342 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP140Q13342 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP140Q13342 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP140Q13342 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP140Q13342 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP140Q13342 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP140Q13342 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP140Q13342 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP140Q13342 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP140Q13342 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP140Q13342 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP140Q13342 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SP140Q13342 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SP140Q13342 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SP140Q13342 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP140Q13342 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP140Q13342 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SP140Q13342 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP140Q13342 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP140Q13342 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP140Q13342 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP140Q13342 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP140Q13342 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP140Q13342 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP140Q13342 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP140Q13342 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SP140Q13342 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SP140Q13342 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SP140Q13342 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SP140Q13342 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SP140Q13342 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SP140Q13342 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SP140Q13342 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP140Q13342 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SP140Q13342 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP140Q13342 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP140Q13342 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP140Q13342 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SP140Q13342 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP140Q13342 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP140Q13342 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP140Q13342 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP140Q13342 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SP140Q13342 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SP140Q13342 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP140Q13342 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP140Q13342 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SP140Q13342 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP140Q13342 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SP140Q13342 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SP140Q13342 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SP140Q13342 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SP140Q13342 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SP140Q13342 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SP140Q13342 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP140Q13342 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP140Q13342 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP140Q13342 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP140Q13342 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP140Q13342 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP140Q13342 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP140Q13342 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP140Q13342 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP140Q13342 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP140Q13342 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SP140Q13342 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SP140Q13342 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SP140Q13342 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SP140Q13342 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SP140Q13342 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SP140Q13342 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SP140Q13342 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SP140Q13342 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SP140Q13342 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP140Q13342 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP140Q13342 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SP140Q13342 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SP140Q13342 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SP140Q13342 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SP140Q13342 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SP140Q13342 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP140Q13342 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP140Q13342 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP140Q13342 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP140Q13342 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP140Q13342 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SP140Q13342 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SP140Q13342 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP140Q13342 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP140Q13342 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP140Q13342 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP140Q13342 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP140Q13342 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
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