Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MKRN3Q13064 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MKRN3Q13064 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MKRN3Q13064 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MKRN3Q13064 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MKRN3Q13064 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MKRN3Q13064 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MKRN3Q13064 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MKRN3Q13064 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MKRN3Q13064 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MKRN3Q13064 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
MKRN3Q13064 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MKRN3Q13064 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MKRN3Q13064 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MKRN3Q13064 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
MKRN3Q13064 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
MKRN3Q13064 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MKRN3Q13064 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MKRN3Q13064 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MKRN3Q13064 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MKRN3Q13064 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MKRN3Q13064 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MKRN3Q13064 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
MKRN3Q13064 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MKRN3Q13064 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MKRN3Q13064 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MKRN3Q13064 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
MKRN3Q13064 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MKRN3Q13064 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MKRN3Q13064 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MKRN3Q13064 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MKRN3Q13064 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
MKRN3Q13064 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MKRN3Q13064 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MKRN3Q13064 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MKRN3Q13064 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MKRN3Q13064 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MKRN3Q13064 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
MKRN3Q13064 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MKRN3Q13064 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MKRN3Q13064 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MKRN3Q13064 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MKRN3Q13064 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
MKRN3Q13064 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MKRN3Q13064 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MKRN3Q13064 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MKRN3Q13064 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MKRN3Q13064 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MKRN3Q13064 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MKRN3Q13064 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MKRN3Q13064 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MKRN3Q13064 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MKRN3Q13064 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MKRN3Q13064 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MKRN3Q13064 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MKRN3Q13064 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MKRN3Q13064 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
MKRN3Q13064 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MKRN3Q13064 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MKRN3Q13064 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
MKRN3Q13064 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MKRN3Q13064 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MKRN3Q13064 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
MKRN3Q13064 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MKRN3Q13064 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MKRN3Q13064 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
MKRN3Q13064 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MKRN3Q13064 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MKRN3Q13064 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MKRN3Q13064 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
MKRN3Q13064 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
MKRN3Q13064 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MKRN3Q13064 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MKRN3Q13064 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
MKRN3Q13064 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MKRN3Q13064 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MKRN3Q13064 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MKRN3Q13064 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MKRN3Q13064 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MKRN3Q13064 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MKRN3Q13064 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MKRN3Q13064 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MKRN3Q13064 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MKRN3Q13064 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MKRN3Q13064 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MKRN3Q13064 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MKRN3Q13064 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MKRN3Q13064 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MKRN3Q13064 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
MKRN3Q13064 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MKRN3Q13064 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MKRN3Q13064 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MKRN3Q13064 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MKRN3Q13064 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MKRN3Q13064 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MKRN3Q13064 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
MKRN3Q13064 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MKRN3Q13064 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
MKRN3Q13064 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MKRN3Q13064 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
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