Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TWF1Q12792 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TWF1Q12792 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TWF1Q12792 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TWF1Q12792 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TWF1Q12792 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TWF1Q12792 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TWF1Q12792 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TWF1Q12792 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TWF1Q12792 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TWF1Q12792 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TWF1Q12792 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TWF1Q12792 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TWF1Q12792 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TWF1Q12792 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TWF1Q12792 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TWF1Q12792 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TWF1Q12792 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWF1Q12792 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWF1Q12792 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWF1Q12792 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWF1Q12792 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TWF1Q12792 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TWF1Q12792 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TWF1Q12792 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TWF1Q12792 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TWF1Q12792 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TWF1Q12792 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TWF1Q12792 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TWF1Q12792 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TWF1Q12792 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TWF1Q12792 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TWF1Q12792 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TWF1Q12792 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TWF1Q12792 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TWF1Q12792 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TWF1Q12792 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TWF1Q12792 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TWF1Q12792 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TWF1Q12792 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TWF1Q12792 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TWF1Q12792 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TWF1Q12792 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TWF1Q12792 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TWF1Q12792 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TWF1Q12792 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TWF1Q12792 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TWF1Q12792 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TWF1Q12792 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms