Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCAPQ12770 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCAPQ12770 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCAPQ12770 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAPQ12770 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAPQ12770 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAPQ12770 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAPQ12770 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAPQ12770 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAPQ12770 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAPQ12770 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAPQ12770 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAPQ12770 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAPQ12770 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCAPQ12770 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCAPQ12770 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCAPQ12770 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAPQ12770 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAPQ12770 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAPQ12770 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAPQ12770 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAPQ12770 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAPQ12770 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAPQ12770 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAPQ12770 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAPQ12770 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAPQ12770 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAPQ12770 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAPQ12770 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPQ12770 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPQ12770 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPQ12770 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPQ12770 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPQ12770 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPQ12770 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPQ12770 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAPQ12770 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAPQ12770 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAPQ12770 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAPQ12770 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAPQ12770 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAPQ12770 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAPQ12770 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCAPQ12770 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCAPQ12770 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SCAPQ12770 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCAPQ12770 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAPQ12770 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAPQ12770 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAPQ12770 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAPQ12770 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAPQ12770 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAPQ12770 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAPQ12770 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAPQ12770 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAPQ12770 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAPQ12770 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAPQ12770 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAPQ12770 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAPQ12770 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPQ12770 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPQ12770 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAPQ12770 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAPQ12770 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAPQ12770 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAPQ12770 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAPQ12770 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAPQ12770 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAPQ12770 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAPQ12770 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAPQ12770 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAPQ12770 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAPQ12770 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
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