Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC173Q0VFZ6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC173Q0VFZ6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC173Q0VFZ6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC173Q0VFZ6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC173Q0VFZ6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC173Q0VFZ6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC173Q0VFZ6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC173Q0VFZ6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC173Q0VFZ6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC173Q0VFZ6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC173Q0VFZ6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC173Q0VFZ6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC173Q0VFZ6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC173Q0VFZ6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC173Q0VFZ6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC173Q0VFZ6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC173Q0VFZ6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC173Q0VFZ6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC173Q0VFZ6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC173Q0VFZ6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC173Q0VFZ6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC173Q0VFZ6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC173Q0VFZ6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC173Q0VFZ6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC173Q0VFZ6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC173Q0VFZ6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC173Q0VFZ6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC173Q0VFZ6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC173Q0VFZ6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC173Q0VFZ6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC173Q0VFZ6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC173Q0VFZ6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC173Q0VFZ6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC173Q0VFZ6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC173Q0VFZ6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC173Q0VFZ6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC173Q0VFZ6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC173Q0VFZ6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC173Q0VFZ6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC173Q0VFZ6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC173Q0VFZ6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC173Q0VFZ6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC173Q0VFZ6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC173Q0VFZ6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC173Q0VFZ6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC173Q0VFZ6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC173Q0VFZ6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC173Q0VFZ6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC173Q0VFZ6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC173Q0VFZ6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC173Q0VFZ6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC173Q0VFZ6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC173Q0VFZ6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC173Q0VFZ6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC173Q0VFZ6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC173Q0VFZ6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC173Q0VFZ6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC173Q0VFZ6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC173Q0VFZ6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC173Q0VFZ6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC173Q0VFZ6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC173Q0VFZ6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC173Q0VFZ6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC173Q0VFZ6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC173Q0VFZ6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC173Q0VFZ6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC173Q0VFZ6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC173Q0VFZ6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC173Q0VFZ6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC173Q0VFZ6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC173Q0VFZ6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC173Q0VFZ6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC173Q0VFZ6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC173Q0VFZ6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC173Q0VFZ6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC173Q0VFZ6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC173Q0VFZ6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC173Q0VFZ6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC173Q0VFZ6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC173Q0VFZ6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC173Q0VFZ6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC173Q0VFZ6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC173Q0VFZ6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC173Q0VFZ6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC173Q0VFZ6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC173Q0VFZ6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC173Q0VFZ6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC173Q0VFZ6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC173Q0VFZ6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC173Q0VFZ6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC173Q0VFZ6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC173Q0VFZ6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC173Q0VFZ6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms