Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.74
ABCC8Q09428 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.74
ABCC8Q09428 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
ABCC8Q09428 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
ABCC8Q09428 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
ABCC8Q09428 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
ABCC8Q09428 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
ABCC8Q09428 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
ABCC8Q09428 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
ABCC8Q09428 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
ABCC8Q09428 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC44.61■■■■■ 4.73
ABCC8Q09428 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
ABCC8Q09428 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
ABCC8Q09428 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
ABCC8Q09428 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
ABCC8Q09428 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
ABCC8Q09428 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
ABCC8Q09428 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
ABCC8Q09428 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
ABCC8Q09428 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC44.58■■■■■ 4.73
ABCC8Q09428 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
ABCC8Q09428 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.56■■■■■ 4.72
ABCC8Q09428 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
ABCC8Q09428 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC44.56■■■■■ 4.72
ABCC8Q09428 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
ABCC8Q09428 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC44.55■■■■■ 4.72
ABCC8Q09428 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
ABCC8Q09428 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.51■■■■■ 4.72
ABCC8Q09428 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
ABCC8Q09428 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
ABCC8Q09428 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC44.48■■■■■ 4.71
ABCC8Q09428 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
ABCC8Q09428 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC44.47■■■■■ 4.71
ABCC8Q09428 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.47■■■■■ 4.71
ABCC8Q09428 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
ABCC8Q09428 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
ABCC8Q09428 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
ABCC8Q09428 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
ABCC8Q09428 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC44.45■■■■■ 4.71
ABCC8Q09428 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
ABCC8Q09428 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC44.43■■■■■ 4.7
ABCC8Q09428 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
ABCC8Q09428 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
ABCC8Q09428 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC44.43■■■■■ 4.7
ABCC8Q09428 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
ABCC8Q09428 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
ABCC8Q09428 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
ABCC8Q09428 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
ABCC8Q09428 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
ABCC8Q09428 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
ABCC8Q09428 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
ABCC8Q09428 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC44.4■■■■■ 4.7
ABCC8Q09428 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC44.39■■■■■ 4.7
ABCC8Q09428 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
ABCC8Q09428 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
ABCC8Q09428 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
ABCC8Q09428 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
ABCC8Q09428 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.69
ABCC8Q09428 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
ABCC8Q09428 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.38■■■■■ 4.69
ABCC8Q09428 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
ABCC8Q09428 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
ABCC8Q09428 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC44.36■■■■■ 4.69
ABCC8Q09428 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC44.36■■■■■ 4.69
ABCC8Q09428 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
ABCC8Q09428 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC44.36■■■■■ 4.69
ABCC8Q09428 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
ABCC8Q09428 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC44.35■■■■■ 4.69
ABCC8Q09428 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
ABCC8Q09428 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC44.35■■■■■ 4.69
ABCC8Q09428 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
ABCC8Q09428 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
ABCC8Q09428 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
ABCC8Q09428 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
ABCC8Q09428 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
ABCC8Q09428 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
ABCC8Q09428 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
ABCC8Q09428 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
ABCC8Q09428 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
ABCC8Q09428 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
ABCC8Q09428 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC44.28■■■■■ 4.68
ABCC8Q09428 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
ABCC8Q09428 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
ABCC8Q09428 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
ABCC8Q09428 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
ABCC8Q09428 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
ABCC8Q09428 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
ABCC8Q09428 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
ABCC8Q09428 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
ABCC8Q09428 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.23■■■■■ 4.67
ABCC8Q09428 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
ABCC8Q09428 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
ABCC8Q09428 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
ABCC8Q09428 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
ABCC8Q09428 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
ABCC8Q09428 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC44.21■■■■■ 4.67
ABCC8Q09428 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
ABCC8Q09428 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC44.2■■■■■ 4.67
ABCC8Q09428 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
ABCC8Q09428 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.18■■■■■ 4.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms