Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TYRO3Q06418 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TYRO3Q06418 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TYRO3Q06418 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TYRO3Q06418 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TYRO3Q06418 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TYRO3Q06418 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TYRO3Q06418 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TYRO3Q06418 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TYRO3Q06418 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TYRO3Q06418 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TYRO3Q06418 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TYRO3Q06418 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TYRO3Q06418 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TYRO3Q06418 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TYRO3Q06418 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TYRO3Q06418 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TYRO3Q06418 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TYRO3Q06418 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TYRO3Q06418 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TYRO3Q06418 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TYRO3Q06418 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TYRO3Q06418 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TYRO3Q06418 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TYRO3Q06418 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TYRO3Q06418 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TYRO3Q06418 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TYRO3Q06418 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TYRO3Q06418 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TYRO3Q06418 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TYRO3Q06418 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TYRO3Q06418 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TYRO3Q06418 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TYRO3Q06418 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TYRO3Q06418 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TYRO3Q06418 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TYRO3Q06418 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TYRO3Q06418 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TYRO3Q06418 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TYRO3Q06418 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TYRO3Q06418 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TYRO3Q06418 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TYRO3Q06418 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TYRO3Q06418 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TYRO3Q06418 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TYRO3Q06418 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TYRO3Q06418 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TYRO3Q06418 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TYRO3Q06418 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TYRO3Q06418 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TYRO3Q06418 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TYRO3Q06418 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TYRO3Q06418 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TYRO3Q06418 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TYRO3Q06418 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TYRO3Q06418 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TYRO3Q06418 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TYRO3Q06418 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TYRO3Q06418 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TYRO3Q06418 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TYRO3Q06418 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TYRO3Q06418 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TYRO3Q06418 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TYRO3Q06418 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TYRO3Q06418 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TYRO3Q06418 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TYRO3Q06418 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TYRO3Q06418 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TYRO3Q06418 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TYRO3Q06418 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TYRO3Q06418 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TYRO3Q06418 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TYRO3Q06418 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TYRO3Q06418 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TYRO3Q06418 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TYRO3Q06418 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TYRO3Q06418 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TYRO3Q06418 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TYRO3Q06418 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TYRO3Q06418 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TYRO3Q06418 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TYRO3Q06418 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TYRO3Q06418 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TYRO3Q06418 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TYRO3Q06418 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TYRO3Q06418 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TYRO3Q06418 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TYRO3Q06418 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TYRO3Q06418 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TYRO3Q06418 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TYRO3Q06418 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TYRO3Q06418 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TYRO3Q06418 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TYRO3Q06418 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TYRO3Q06418 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TYRO3Q06418 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TYRO3Q06418 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TYRO3Q06418 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TYRO3Q06418 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TYRO3Q06418 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms