Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PSME1Q06323 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PSME1Q06323 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PSME1Q06323 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PSME1Q06323 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PSME1Q06323 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PSME1Q06323 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PSME1Q06323 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PSME1Q06323 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PSME1Q06323 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PSME1Q06323 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PSME1Q06323 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PSME1Q06323 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PSME1Q06323 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PSME1Q06323 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
PSME1Q06323 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PSME1Q06323 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PSME1Q06323 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PSME1Q06323 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PSME1Q06323 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PSME1Q06323 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PSME1Q06323 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PSME1Q06323 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PSME1Q06323 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
PSME1Q06323 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PSME1Q06323 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PSME1Q06323 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
PSME1Q06323 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
PSME1Q06323 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PSME1Q06323 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PSME1Q06323 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
PSME1Q06323 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
PSME1Q06323 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PSME1Q06323 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PSME1Q06323 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PSME1Q06323 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PSME1Q06323 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PSME1Q06323 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
PSME1Q06323 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PSME1Q06323 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PSME1Q06323 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PSME1Q06323 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
PSME1Q06323 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PSME1Q06323 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PSME1Q06323 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PSME1Q06323 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PSME1Q06323 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
PSME1Q06323 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
PSME1Q06323 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PSME1Q06323 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PSME1Q06323 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PSME1Q06323 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PSME1Q06323 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PSME1Q06323 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PSME1Q06323 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PSME1Q06323 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PSME1Q06323 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PSME1Q06323 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PSME1Q06323 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PSME1Q06323 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PSME1Q06323 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
PSME1Q06323 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PSME1Q06323 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
PSME1Q06323 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PSME1Q06323 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PSME1Q06323 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PSME1Q06323 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PSME1Q06323 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PSME1Q06323 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PSME1Q06323 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PSME1Q06323 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PSME1Q06323 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PSME1Q06323 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PSME1Q06323 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PSME1Q06323 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
PSME1Q06323 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PSME1Q06323 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PSME1Q06323 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
PSME1Q06323 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PSME1Q06323 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PSME1Q06323 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PSME1Q06323 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
PSME1Q06323 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
PSME1Q06323 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PSME1Q06323 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PSME1Q06323 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
PSME1Q06323 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
PSME1Q06323 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PSME1Q06323 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PSME1Q06323 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PSME1Q06323 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PSME1Q06323 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PSME1Q06323 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PSME1Q06323 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PSME1Q06323 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PSME1Q06323 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PSME1Q06323 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PSME1Q06323 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PSME1Q06323 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PSME1Q06323 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms