Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPN11Q06124 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPN11Q06124 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPN11Q06124 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPN11Q06124 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPN11Q06124 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPN11Q06124 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPN11Q06124 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPN11Q06124 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPN11Q06124 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPN11Q06124 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPN11Q06124 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPN11Q06124 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPN11Q06124 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPN11Q06124 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPN11Q06124 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPN11Q06124 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPN11Q06124 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPN11Q06124 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPN11Q06124 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPN11Q06124 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPN11Q06124 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPN11Q06124 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPN11Q06124 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPN11Q06124 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN11Q06124 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN11Q06124 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN11Q06124 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN11Q06124 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN11Q06124 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPN11Q06124 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPN11Q06124 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPN11Q06124 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPN11Q06124 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPN11Q06124 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPN11Q06124 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPN11Q06124 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPN11Q06124 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPN11Q06124 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPN11Q06124 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN11Q06124 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN11Q06124 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN11Q06124 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPN11Q06124 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPN11Q06124 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPN11Q06124 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN11Q06124 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN11Q06124 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN11Q06124 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN11Q06124 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN11Q06124 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN11Q06124 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN11Q06124 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN11Q06124 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN11Q06124 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN11Q06124 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPN11Q06124 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPN11Q06124 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN11Q06124 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN11Q06124 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN11Q06124 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN11Q06124 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN11Q06124 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN11Q06124 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN11Q06124 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN11Q06124 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN11Q06124 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPN11Q06124 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPN11Q06124 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPN11Q06124 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN11Q06124 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN11Q06124 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN11Q06124 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN11Q06124 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN11Q06124 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN11Q06124 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN11Q06124 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN11Q06124 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN11Q06124 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPN11Q06124 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPN11Q06124 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN11Q06124 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN11Q06124 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN11Q06124 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN11Q06124 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN11Q06124 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN11Q06124 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN11Q06124 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN11Q06124 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN11Q06124 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN11Q06124 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN11Q06124 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN11Q06124 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN11Q06124 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN11Q06124 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN11Q06124 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN11Q06124 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPN11Q06124 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPN11Q06124 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPN11Q06124 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms