Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB3Q05901 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB3Q05901 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB3Q05901 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB3Q05901 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNB3Q05901 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNB3Q05901 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNB3Q05901 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNB3Q05901 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNB3Q05901 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNB3Q05901 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNB3Q05901 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNB3Q05901 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNB3Q05901 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB3Q05901 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB3Q05901 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB3Q05901 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB3Q05901 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB3Q05901 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB3Q05901 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB3Q05901 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB3Q05901 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB3Q05901 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNB3Q05901 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNB3Q05901 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNB3Q05901 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHRNB3Q05901 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNB3Q05901 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNB3Q05901 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNB3Q05901 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNB3Q05901 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNB3Q05901 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNB3Q05901 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNB3Q05901 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNB3Q05901 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNB3Q05901 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNB3Q05901 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNB3Q05901 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNB3Q05901 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNB3Q05901 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNB3Q05901 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNB3Q05901 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNB3Q05901 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNB3Q05901 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNB3Q05901 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNB3Q05901 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNB3Q05901 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNB3Q05901 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNB3Q05901 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHRNB3Q05901 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms