Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRKCZQ05513 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRKCZQ05513 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRKCZQ05513 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRKCZQ05513 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRKCZQ05513 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRKCZQ05513 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRKCZQ05513 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRKCZQ05513 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRKCZQ05513 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRKCZQ05513 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRKCZQ05513 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PRKCZQ05513 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRKCZQ05513 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRKCZQ05513 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRKCZQ05513 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRKCZQ05513 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRKCZQ05513 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRKCZQ05513 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PRKCZQ05513 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRKCZQ05513 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRKCZQ05513 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRKCZQ05513 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRKCZQ05513 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRKCZQ05513 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRKCZQ05513 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PRKCZQ05513 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRKCZQ05513 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRKCZQ05513 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRKCZQ05513 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRKCZQ05513 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRKCZQ05513 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRKCZQ05513 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PRKCZQ05513 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRKCZQ05513 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRKCZQ05513 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRKCZQ05513 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PRKCZQ05513 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PRKCZQ05513 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PRKCZQ05513 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKCZQ05513 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKCZQ05513 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKCZQ05513 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKCZQ05513 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRKCZQ05513 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRKCZQ05513 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRKCZQ05513 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PRKCZQ05513 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRKCZQ05513 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRKCZQ05513 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRKCZQ05513 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRKCZQ05513 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRKCZQ05513 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRKCZQ05513 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PRKCZQ05513 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRKCZQ05513 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRKCZQ05513 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRKCZQ05513 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRKCZQ05513 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRKCZQ05513 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRKCZQ05513 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRKCZQ05513 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PRKCZQ05513 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRKCZQ05513 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRKCZQ05513 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PRKCZQ05513 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRKCZQ05513 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PRKCZQ05513 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRKCZQ05513 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRKCZQ05513 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PRKCZQ05513 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRKCZQ05513 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRKCZQ05513 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRKCZQ05513 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRKCZQ05513 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKCZQ05513 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRKCZQ05513 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRKCZQ05513 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRKCZQ05513 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRKCZQ05513 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRKCZQ05513 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRKCZQ05513 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRKCZQ05513 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PRKCZQ05513 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PRKCZQ05513 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRKCZQ05513 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRKCZQ05513 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRKCZQ05513 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRKCZQ05513 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRKCZQ05513 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRKCZQ05513 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRKCZQ05513 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRKCZQ05513 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRKCZQ05513 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRKCZQ05513 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRKCZQ05513 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRKCZQ05513 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PRKCZQ05513 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKCZQ05513 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKCZQ05513 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms