Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNFAIP2Q03169 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNFAIP2Q03169 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNFAIP2Q03169 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNFAIP2Q03169 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNFAIP2Q03169 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNFAIP2Q03169 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNFAIP2Q03169 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TNFAIP2Q03169 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNFAIP2Q03169 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNFAIP2Q03169 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNFAIP2Q03169 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFAIP2Q03169 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFAIP2Q03169 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFAIP2Q03169 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNFAIP2Q03169 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNFAIP2Q03169 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNFAIP2Q03169 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFAIP2Q03169 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFAIP2Q03169 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFAIP2Q03169 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFAIP2Q03169 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFAIP2Q03169 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFAIP2Q03169 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNFAIP2Q03169 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNFAIP2Q03169 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNFAIP2Q03169 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNFAIP2Q03169 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNFAIP2Q03169 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNFAIP2Q03169 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNFAIP2Q03169 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNFAIP2Q03169 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNFAIP2Q03169 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNFAIP2Q03169 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNFAIP2Q03169 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNFAIP2Q03169 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNFAIP2Q03169 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNFAIP2Q03169 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNFAIP2Q03169 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNFAIP2Q03169 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNFAIP2Q03169 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNFAIP2Q03169 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNFAIP2Q03169 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TNFAIP2Q03169 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNFAIP2Q03169 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TNFAIP2Q03169 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TNFAIP2Q03169 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNFAIP2Q03169 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNFAIP2Q03169 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNFAIP2Q03169 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNFAIP2Q03169 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNFAIP2Q03169 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TNFAIP2Q03169 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNFAIP2Q03169 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNFAIP2Q03169 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNFAIP2Q03169 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNFAIP2Q03169 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNFAIP2Q03169 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNFAIP2Q03169 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNFAIP2Q03169 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNFAIP2Q03169 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNFAIP2Q03169 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNFAIP2Q03169 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNFAIP2Q03169 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNFAIP2Q03169 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNFAIP2Q03169 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TNFAIP2Q03169 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TNFAIP2Q03169 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNFAIP2Q03169 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNFAIP2Q03169 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNFAIP2Q03169 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNFAIP2Q03169 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNFAIP2Q03169 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNFAIP2Q03169 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNFAIP2Q03169 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNFAIP2Q03169 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNFAIP2Q03169 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNFAIP2Q03169 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNFAIP2Q03169 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNFAIP2Q03169 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNFAIP2Q03169 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNFAIP2Q03169 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNFAIP2Q03169 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNFAIP2Q03169 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNFAIP2Q03169 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TNFAIP2Q03169 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNFAIP2Q03169 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TNFAIP2Q03169 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNFAIP2Q03169 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNFAIP2Q03169 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNFAIP2Q03169 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNFAIP2Q03169 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNFAIP2Q03169 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNFAIP2Q03169 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNFAIP2Q03169 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNFAIP2Q03169 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNFAIP2Q03169 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNFAIP2Q03169 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNFAIP2Q03169 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TNFAIP2Q03169 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms