Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CNTN2Q02246 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNTN2Q02246 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNTN2Q02246 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNTN2Q02246 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNTN2Q02246 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNTN2Q02246 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNTN2Q02246 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNTN2Q02246 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNTN2Q02246 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CNTN2Q02246 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNTN2Q02246 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNTN2Q02246 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNTN2Q02246 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNTN2Q02246 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNTN2Q02246 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNTN2Q02246 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNTN2Q02246 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CNTN2Q02246 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNTN2Q02246 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNTN2Q02246 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNTN2Q02246 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNTN2Q02246 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNTN2Q02246 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNTN2Q02246 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNTN2Q02246 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNTN2Q02246 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNTN2Q02246 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNTN2Q02246 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNTN2Q02246 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNTN2Q02246 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNTN2Q02246 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNTN2Q02246 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNTN2Q02246 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CNTN2Q02246 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNTN2Q02246 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CNTN2Q02246 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNTN2Q02246 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNTN2Q02246 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CNTN2Q02246 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNTN2Q02246 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNTN2Q02246 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNTN2Q02246 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNTN2Q02246 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNTN2Q02246 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNTN2Q02246 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNTN2Q02246 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNTN2Q02246 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CNTN2Q02246 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNTN2Q02246 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNTN2Q02246 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNTN2Q02246 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNTN2Q02246 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CNTN2Q02246 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNTN2Q02246 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CNTN2Q02246 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNTN2Q02246 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNTN2Q02246 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNTN2Q02246 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNTN2Q02246 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNTN2Q02246 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNTN2Q02246 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNTN2Q02246 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNTN2Q02246 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNTN2Q02246 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNTN2Q02246 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNTN2Q02246 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNTN2Q02246 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNTN2Q02246 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNTN2Q02246 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNTN2Q02246 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNTN2Q02246 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNTN2Q02246 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNTN2Q02246 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms