Protein–RNA interactions for Protein: Q01973

ROR1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROR1Q01973 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ROR1Q01973 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ROR1Q01973 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ROR1Q01973 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ROR1Q01973 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ROR1Q01973 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ROR1Q01973 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ROR1Q01973 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ROR1Q01973 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ROR1Q01973 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ROR1Q01973 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ROR1Q01973 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ROR1Q01973 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ROR1Q01973 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ROR1Q01973 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ROR1Q01973 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ROR1Q01973 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ROR1Q01973 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ROR1Q01973 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ROR1Q01973 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ROR1Q01973 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ROR1Q01973 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ROR1Q01973 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ROR1Q01973 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ROR1Q01973 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ROR1Q01973 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ROR1Q01973 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ROR1Q01973 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ROR1Q01973 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ROR1Q01973 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ROR1Q01973 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ROR1Q01973 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ROR1Q01973 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ROR1Q01973 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ROR1Q01973 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ROR1Q01973 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ROR1Q01973 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ROR1Q01973 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ROR1Q01973 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ROR1Q01973 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ROR1Q01973 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ROR1Q01973 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ROR1Q01973 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ROR1Q01973 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ROR1Q01973 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ROR1Q01973 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ROR1Q01973 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ROR1Q01973 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ROR1Q01973 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ROR1Q01973 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ROR1Q01973 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ROR1Q01973 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ROR1Q01973 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ROR1Q01973 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ROR1Q01973 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ROR1Q01973 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ROR1Q01973 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ROR1Q01973 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ROR1Q01973 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ROR1Q01973 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ROR1Q01973 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ROR1Q01973 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ROR1Q01973 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ROR1Q01973 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ROR1Q01973 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ROR1Q01973 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ROR1Q01973 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ROR1Q01973 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ROR1Q01973 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ROR1Q01973 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ROR1Q01973 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms