Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLCB3Q01970 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLCB3Q01970 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PLCB3Q01970 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PLCB3Q01970 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PLCB3Q01970 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLCB3Q01970 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLCB3Q01970 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLCB3Q01970 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLCB3Q01970 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLCB3Q01970 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLCB3Q01970 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLCB3Q01970 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLCB3Q01970 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLCB3Q01970 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PLCB3Q01970 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLCB3Q01970 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLCB3Q01970 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLCB3Q01970 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLCB3Q01970 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLCB3Q01970 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLCB3Q01970 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PLCB3Q01970 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLCB3Q01970 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PLCB3Q01970 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLCB3Q01970 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLCB3Q01970 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLCB3Q01970 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PLCB3Q01970 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLCB3Q01970 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLCB3Q01970 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLCB3Q01970 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLCB3Q01970 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLCB3Q01970 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLCB3Q01970 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLCB3Q01970 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLCB3Q01970 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLCB3Q01970 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PLCB3Q01970 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLCB3Q01970 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLCB3Q01970 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PLCB3Q01970 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLCB3Q01970 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLCB3Q01970 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLCB3Q01970 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLCB3Q01970 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLCB3Q01970 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLCB3Q01970 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLCB3Q01970 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLCB3Q01970 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLCB3Q01970 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLCB3Q01970 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PLCB3Q01970 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLCB3Q01970 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLCB3Q01970 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLCB3Q01970 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLCB3Q01970 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PLCB3Q01970 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLCB3Q01970 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLCB3Q01970 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLCB3Q01970 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLCB3Q01970 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLCB3Q01970 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLCB3Q01970 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLCB3Q01970 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLCB3Q01970 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLCB3Q01970 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLCB3Q01970 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLCB3Q01970 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLCB3Q01970 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLCB3Q01970 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLCB3Q01970 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms