Protein–RNA interactions for Protein: Q01453

PMP22, Peripheral myelin protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMP22Q01453 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMP22Q01453 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMP22Q01453 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PMP22Q01453 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMP22Q01453 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMP22Q01453 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMP22Q01453 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMP22Q01453 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMP22Q01453 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMP22Q01453 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMP22Q01453 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMP22Q01453 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMP22Q01453 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMP22Q01453 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PMP22Q01453 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMP22Q01453 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PMP22Q01453 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMP22Q01453 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMP22Q01453 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMP22Q01453 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMP22Q01453 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMP22Q01453 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMP22Q01453 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMP22Q01453 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMP22Q01453 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMP22Q01453 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMP22Q01453 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMP22Q01453 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMP22Q01453 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMP22Q01453 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMP22Q01453 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMP22Q01453 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMP22Q01453 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PMP22Q01453 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMP22Q01453 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMP22Q01453 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMP22Q01453 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PMP22Q01453 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMP22Q01453 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMP22Q01453 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMP22Q01453 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PMP22Q01453 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMP22Q01453 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMP22Q01453 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMP22Q01453 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMP22Q01453 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMP22Q01453 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMP22Q01453 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PMP22Q01453 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMP22Q01453 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMP22Q01453 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMP22Q01453 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMP22Q01453 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PMP22Q01453 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMP22Q01453 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMP22Q01453 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PMP22Q01453 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMP22Q01453 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMP22Q01453 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMP22Q01453 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMP22Q01453 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMP22Q01453 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMP22Q01453 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMP22Q01453 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMP22Q01453 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PMP22Q01453 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMP22Q01453 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMP22Q01453 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMP22Q01453 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms