Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RUNX1Q01196 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX1Q01196 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX1Q01196 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX1Q01196 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX1Q01196 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX1Q01196 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX1Q01196 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX1Q01196 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX1Q01196 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX1Q01196 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX1Q01196 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX1Q01196 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX1Q01196 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX1Q01196 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX1Q01196 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX1Q01196 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX1Q01196 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX1Q01196 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX1Q01196 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX1Q01196 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX1Q01196 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX1Q01196 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX1Q01196 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX1Q01196 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX1Q01196 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX1Q01196 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX1Q01196 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX1Q01196 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX1Q01196 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX1Q01196 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX1Q01196 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX1Q01196 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX1Q01196 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX1Q01196 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX1Q01196 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX1Q01196 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX1Q01196 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX1Q01196 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX1Q01196 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX1Q01196 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX1Q01196 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX1Q01196 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX1Q01196 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX1Q01196 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RUNX1Q01196 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms