Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTD2P86397 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTD2P86397 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTD2P86397 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTD2P86397 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTD2P86397 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTD2P86397 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTD2P86397 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTD2P86397 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HTD2P86397 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTD2P86397 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTD2P86397 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTD2P86397 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTD2P86397 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTD2P86397 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTD2P86397 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTD2P86397 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTD2P86397 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTD2P86397 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTD2P86397 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTD2P86397 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTD2P86397 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HTD2P86397 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTD2P86397 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTD2P86397 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTD2P86397 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTD2P86397 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTD2P86397 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTD2P86397 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTD2P86397 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTD2P86397 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTD2P86397 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTD2P86397 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTD2P86397 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HTD2P86397 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTD2P86397 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTD2P86397 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTD2P86397 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HTD2P86397 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTD2P86397 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTD2P86397 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HTD2P86397 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HTD2P86397 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HTD2P86397 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTD2P86397 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTD2P86397 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTD2P86397 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTD2P86397 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTD2P86397 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTD2P86397 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTD2P86397 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTD2P86397 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTD2P86397 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTD2P86397 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTD2P86397 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTD2P86397 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTD2P86397 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTD2P86397 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTD2P86397 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HTD2P86397 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTD2P86397 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTD2P86397 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTD2P86397 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HTD2P86397 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTD2P86397 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTD2P86397 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTD2P86397 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTD2P86397 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTD2P86397 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTD2P86397 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HTD2P86397 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTD2P86397 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTD2P86397 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTD2P86397 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HTD2P86397 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HTD2P86397 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HTD2P86397 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTD2P86397 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HTD2P86397 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTD2P86397 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTD2P86397 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTD2P86397 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTD2P86397 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTD2P86397 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTD2P86397 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTD2P86397 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTD2P86397 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTD2P86397 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTD2P86397 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTD2P86397 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTD2P86397 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTD2P86397 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTD2P86397 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTD2P86397 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTD2P86397 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTD2P86397 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTD2P86397 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTD2P86397 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTD2P86397 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HTD2P86397 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms