Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKOR1P84550 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SKOR1P84550 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKOR1P84550 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKOR1P84550 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKOR1P84550 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKOR1P84550 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SKOR1P84550 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKOR1P84550 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKOR1P84550 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SKOR1P84550 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKOR1P84550 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKOR1P84550 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SKOR1P84550 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SKOR1P84550 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SKOR1P84550 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SKOR1P84550 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SKOR1P84550 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKOR1P84550 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKOR1P84550 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SKOR1P84550 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SKOR1P84550 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SKOR1P84550 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SKOR1P84550 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SKOR1P84550 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SKOR1P84550 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SKOR1P84550 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SKOR1P84550 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKOR1P84550 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKOR1P84550 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKOR1P84550 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SKOR1P84550 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKOR1P84550 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKOR1P84550 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKOR1P84550 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKOR1P84550 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKOR1P84550 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKOR1P84550 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKOR1P84550 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKOR1P84550 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKOR1P84550 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKOR1P84550 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKOR1P84550 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKOR1P84550 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKOR1P84550 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKOR1P84550 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKOR1P84550 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKOR1P84550 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKOR1P84550 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKOR1P84550 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SKOR1P84550 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SKOR1P84550 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SKOR1P84550 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SKOR1P84550 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKOR1P84550 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKOR1P84550 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKOR1P84550 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKOR1P84550 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKOR1P84550 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKOR1P84550 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKOR1P84550 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SKOR1P84550 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SKOR1P84550 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SKOR1P84550 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SKOR1P84550 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SKOR1P84550 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SKOR1P84550 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKOR1P84550 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKOR1P84550 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SKOR1P84550 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SKOR1P84550 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKOR1P84550 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKOR1P84550 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKOR1P84550 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SKOR1P84550 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKOR1P84550 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SKOR1P84550 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SKOR1P84550 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SKOR1P84550 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SKOR1P84550 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKOR1P84550 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKOR1P84550 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKOR1P84550 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKOR1P84550 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKOR1P84550 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKOR1P84550 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKOR1P84550 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKOR1P84550 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKOR1P84550 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SKOR1P84550 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKOR1P84550 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SKOR1P84550 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SKOR1P84550 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SKOR1P84550 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SKOR1P84550 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKOR1P84550 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKOR1P84550 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKOR1P84550 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKOR1P84550 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SKOR1P84550 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms