Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL7P80098 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCL7P80098 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCL7P80098 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCL7P80098 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCL7P80098 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCL7P80098 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCL7P80098 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL7P80098 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL7P80098 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL7P80098 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL7P80098 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCL7P80098 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCL7P80098 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCL7P80098 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL7P80098 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL7P80098 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL7P80098 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCL7P80098 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCL7P80098 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCL7P80098 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL7P80098 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL7P80098 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL7P80098 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL7P80098 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL7P80098 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL7P80098 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL7P80098 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL7P80098 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL7P80098 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL7P80098 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL7P80098 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL7P80098 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL7P80098 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL7P80098 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL7P80098 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL7P80098 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL7P80098 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL7P80098 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL7P80098 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL7P80098 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL7P80098 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL7P80098 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL7P80098 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL7P80098 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL7P80098 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL7P80098 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL7P80098 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL7P80098 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL7P80098 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL7P80098 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCL7P80098 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCL7P80098 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCL7P80098 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCL7P80098 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCL7P80098 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL7P80098 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL7P80098 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL7P80098 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCL7P80098 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL7P80098 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL7P80098 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL7P80098 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL7P80098 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL7P80098 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL7P80098 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL7P80098 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL7P80098 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL7P80098 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL7P80098 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL7P80098 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL7P80098 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL7P80098 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL7P80098 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL7P80098 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL7P80098 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCL7P80098 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCL7P80098 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCL7P80098 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCL7P80098 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCL7P80098 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCL7P80098 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CCL7P80098 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCL7P80098 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCL7P80098 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCL7P80098 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCL7P80098 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCL7P80098 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCL7P80098 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL7P80098 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL7P80098 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL7P80098 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL7P80098 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL7P80098 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCL7P80098 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCL7P80098 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCL7P80098 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCL7P80098 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCL7P80098 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCL7P80098 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms