Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBB4BP68371 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TUBB4BP68371 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TUBB4BP68371 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBB4BP68371 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBB4BP68371 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBB4BP68371 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBB4BP68371 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBB4BP68371 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBB4BP68371 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBB4BP68371 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBB4BP68371 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBB4BP68371 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBB4BP68371 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBB4BP68371 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBB4BP68371 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBB4BP68371 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBB4BP68371 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBB4BP68371 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBB4BP68371 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBB4BP68371 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBB4BP68371 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBB4BP68371 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBB4BP68371 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBB4BP68371 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBB4BP68371 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBB4BP68371 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBB4BP68371 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBB4BP68371 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBB4BP68371 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBB4BP68371 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBB4BP68371 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBB4BP68371 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBB4BP68371 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBB4BP68371 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBB4BP68371 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBB4BP68371 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBB4BP68371 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBB4BP68371 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBB4BP68371 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBB4BP68371 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBB4BP68371 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBB4BP68371 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBB4BP68371 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBB4BP68371 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBB4BP68371 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBB4BP68371 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBB4BP68371 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TUBB4BP68371 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBB4BP68371 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUBB4BP68371 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TUBB4BP68371 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
TUBB4BP68371 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBB4BP68371 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBB4BP68371 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBB4BP68371 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBB4BP68371 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBB4BP68371 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBB4BP68371 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBB4BP68371 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBB4BP68371 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBB4BP68371 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBB4BP68371 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBB4BP68371 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBB4BP68371 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBB4BP68371 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBB4BP68371 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBB4BP68371 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBB4BP68371 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBB4BP68371 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBB4BP68371 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBB4BP68371 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBB4BP68371 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBB4BP68371 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBB4BP68371 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBB4BP68371 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBB4BP68371 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBB4BP68371 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBB4BP68371 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBB4BP68371 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBB4BP68371 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBB4BP68371 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBB4BP68371 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBB4BP68371 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBB4BP68371 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBB4BP68371 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBB4BP68371 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBB4BP68371 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBB4BP68371 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBB4BP68371 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBB4BP68371 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBB4BP68371 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBB4BP68371 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBB4BP68371 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBB4BP68371 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBB4BP68371 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBB4BP68371 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBB4BP68371 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBB4BP68371 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBB4BP68371 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms