Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTG1P63261 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTG1P63261 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTG1P63261 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTG1P63261 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTG1P63261 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTG1P63261 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms