Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVS71-1P61550 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVS71-1P61550 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVS71-1P61550 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVS71-1P61550 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVS71-1P61550 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVS71-1P61550 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVS71-1P61550 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVS71-1P61550 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVS71-1P61550 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVS71-1P61550 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVS71-1P61550 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVS71-1P61550 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVS71-1P61550 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVS71-1P61550 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVS71-1P61550 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVS71-1P61550 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVS71-1P61550 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms