Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN2P57739 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN2P57739 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN2P57739 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN2P57739 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN2P57739 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN2P57739 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN2P57739 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN2P57739 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN2P57739 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN2P57739 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN2P57739 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN2P57739 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN2P57739 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN2P57739 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN2P57739 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN2P57739 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN2P57739 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN2P57739 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN2P57739 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN2P57739 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN2P57739 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN2P57739 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLDN2P57739 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN2P57739 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN2P57739 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN2P57739 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN2P57739 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN2P57739 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN2P57739 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN2P57739 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN2P57739 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN2P57739 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN2P57739 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN2P57739 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN2P57739 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN2P57739 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN2P57739 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN2P57739 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN2P57739 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN2P57739 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN2P57739 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN2P57739 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN2P57739 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN2P57739 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN2P57739 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN2P57739 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN2P57739 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms