Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATN1P54259 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATN1P54259 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATN1P54259 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATN1P54259 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ATN1P54259 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATN1P54259 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATN1P54259 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATN1P54259 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATN1P54259 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATN1P54259 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATN1P54259 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ATN1P54259 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATN1P54259 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATN1P54259 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATN1P54259 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ATN1P54259 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATN1P54259 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ATN1P54259 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATN1P54259 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATN1P54259 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATN1P54259 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATN1P54259 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATN1P54259 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATN1P54259 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ATN1P54259 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATN1P54259 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATN1P54259 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATN1P54259 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATN1P54259 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATN1P54259 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATN1P54259 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATN1P54259 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATN1P54259 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ATN1P54259 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATN1P54259 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATN1P54259 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATN1P54259 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ATN1P54259 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATN1P54259 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ATN1P54259 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATN1P54259 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATN1P54259 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATN1P54259 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATN1P54259 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATN1P54259 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATN1P54259 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATN1P54259 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATN1P54259 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATN1P54259 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATN1P54259 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATN1P54259 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATN1P54259 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATN1P54259 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATN1P54259 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATN1P54259 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATN1P54259 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATN1P54259 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATN1P54259 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATN1P54259 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATN1P54259 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATN1P54259 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATN1P54259 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ATN1P54259 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ATN1P54259 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATN1P54259 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ATN1P54259 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ATN1P54259 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATN1P54259 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATN1P54259 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATN1P54259 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ATN1P54259 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATN1P54259 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATN1P54259 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATN1P54259 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATN1P54259 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATN1P54259 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATN1P54259 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATN1P54259 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATN1P54259 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ATN1P54259 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATN1P54259 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATN1P54259 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATN1P54259 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATN1P54259 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATN1P54259 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATN1P54259 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATN1P54259 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATN1P54259 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ATN1P54259 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATN1P54259 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATN1P54259 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATN1P54259 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
ATN1P54259 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATN1P54259 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATN1P54259 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATN1P54259 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATN1P54259 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATN1P54259 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ATN1P54259 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms