Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RARSP54136 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RARSP54136 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RARSP54136 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
RARSP54136 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
RARSP54136 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RARSP54136 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
RARSP54136 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RARSP54136 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RARSP54136 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RARSP54136 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RARSP54136 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RARSP54136 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RARSP54136 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RARSP54136 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RARSP54136 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RARSP54136 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RARSP54136 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RARSP54136 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RARSP54136 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RARSP54136 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RARSP54136 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RARSP54136 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RARSP54136 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RARSP54136 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RARSP54136 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RARSP54136 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RARSP54136 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RARSP54136 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
RARSP54136 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RARSP54136 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RARSP54136 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RARSP54136 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33■■■□□ 2.87
RARSP54136 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RARSP54136 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RARSP54136 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
RARSP54136 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RARSP54136 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RARSP54136 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RARSP54136 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RARSP54136 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RARSP54136 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
RARSP54136 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RARSP54136 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RARSP54136 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RARSP54136 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RARSP54136 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RARSP54136 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RARSP54136 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RARSP54136 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RARSP54136 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RARSP54136 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RARSP54136 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RARSP54136 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
RARSP54136 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
RARSP54136 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RARSP54136 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RARSP54136 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RARSP54136 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RARSP54136 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RARSP54136 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RARSP54136 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RARSP54136 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RARSP54136 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RARSP54136 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RARSP54136 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RARSP54136 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RARSP54136 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RARSP54136 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
RARSP54136 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
RARSP54136 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
RARSP54136 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RARSP54136 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RARSP54136 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RARSP54136 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RARSP54136 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RARSP54136 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RARSP54136 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RARSP54136 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RARSP54136 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RARSP54136 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RARSP54136 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RARSP54136 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RARSP54136 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RARSP54136 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RARSP54136 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RARSP54136 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RARSP54136 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RARSP54136 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RARSP54136 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
RARSP54136 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RARSP54136 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RARSP54136 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RARSP54136 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RARSP54136 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RARSP54136 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RARSP54136 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RARSP54136 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RARSP54136 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RARSP54136 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms