Protein–RNA interactions for Protein: P53985

SLC16A1, Monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A1P53985 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC16A1P53985 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC16A1P53985 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC16A1P53985 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC16A1P53985 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC16A1P53985 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC16A1P53985 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC16A1P53985 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC16A1P53985 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC16A1P53985 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC16A1P53985 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC16A1P53985 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC16A1P53985 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC16A1P53985 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC16A1P53985 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC16A1P53985 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC16A1P53985 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC16A1P53985 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC16A1P53985 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC16A1P53985 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC16A1P53985 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC16A1P53985 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC16A1P53985 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC16A1P53985 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC16A1P53985 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC16A1P53985 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC16A1P53985 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC16A1P53985 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC16A1P53985 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC16A1P53985 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC16A1P53985 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC16A1P53985 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC16A1P53985 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC16A1P53985 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC16A1P53985 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC16A1P53985 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC16A1P53985 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC16A1P53985 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC16A1P53985 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC16A1P53985 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC16A1P53985 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC16A1P53985 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC16A1P53985 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC16A1P53985 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC16A1P53985 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC16A1P53985 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC16A1P53985 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC16A1P53985 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC16A1P53985 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC16A1P53985 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC16A1P53985 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC16A1P53985 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC16A1P53985 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC16A1P53985 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC16A1P53985 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC16A1P53985 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC16A1P53985 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC16A1P53985 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC16A1P53985 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC16A1P53985 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC16A1P53985 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC16A1P53985 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC16A1P53985 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC16A1P53985 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC16A1P53985 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC16A1P53985 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC16A1P53985 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC16A1P53985 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC16A1P53985 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC16A1P53985 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC16A1P53985 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC16A1P53985 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms