Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COPAP53621 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COPAP53621 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COPAP53621 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COPAP53621 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPAP53621 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPAP53621 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPAP53621 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
COPAP53621 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPAP53621 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COPAP53621 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COPAP53621 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COPAP53621 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COPAP53621 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COPAP53621 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COPAP53621 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COPAP53621 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COPAP53621 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COPAP53621 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COPAP53621 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COPAP53621 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COPAP53621 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COPAP53621 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COPAP53621 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COPAP53621 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COPAP53621 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COPAP53621 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COPAP53621 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COPAP53621 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COPAP53621 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
COPAP53621 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COPAP53621 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COPAP53621 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COPAP53621 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COPAP53621 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COPAP53621 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COPAP53621 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COPAP53621 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COPAP53621 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COPAP53621 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COPAP53621 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COPAP53621 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COPAP53621 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COPAP53621 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COPAP53621 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COPAP53621 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COPAP53621 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COPAP53621 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COPAP53621 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
COPAP53621 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COPAP53621 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COPAP53621 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COPAP53621 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COPAP53621 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
COPAP53621 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COPAP53621 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
COPAP53621 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COPAP53621 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COPAP53621 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COPAP53621 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
COPAP53621 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COPAP53621 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COPAP53621 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COPAP53621 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COPAP53621 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COPAP53621 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COPAP53621 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COPAP53621 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COPAP53621 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COPAP53621 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COPAP53621 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COPAP53621 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COPAP53621 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COPAP53621 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COPAP53621 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
COPAP53621 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPAP53621 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPAP53621 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPAP53621 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPAP53621 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPAP53621 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPAP53621 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPAP53621 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPAP53621 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPAP53621 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPAP53621 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPAP53621 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPAP53621 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPAP53621 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPAP53621 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPAP53621 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPAP53621 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COPAP53621 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COPAP53621 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COPAP53621 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COPAP53621 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
COPAP53621 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
COPAP53621 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COPAP53621 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COPAP53621 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms