Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HK3P52790 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HK3P52790 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HK3P52790 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HK3P52790 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HK3P52790 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HK3P52790 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HK3P52790 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HK3P52790 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HK3P52790 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HK3P52790 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HK3P52790 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HK3P52790 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HK3P52790 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HK3P52790 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HK3P52790 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HK3P52790 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HK3P52790 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HK3P52790 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HK3P52790 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HK3P52790 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HK3P52790 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HK3P52790 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HK3P52790 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HK3P52790 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HK3P52790 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HK3P52790 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HK3P52790 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HK3P52790 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HK3P52790 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HK3P52790 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HK3P52790 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HK3P52790 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HK3P52790 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HK3P52790 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HK3P52790 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HK3P52790 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HK3P52790 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HK3P52790 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HK3P52790 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HK3P52790 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HK3P52790 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HK3P52790 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HK3P52790 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HK3P52790 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HK3P52790 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HK3P52790 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HK3P52790 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HK3P52790 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HK3P52790 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HK3P52790 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HK3P52790 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HK3P52790 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HK3P52790 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HK3P52790 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HK3P52790 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HK3P52790 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HK3P52790 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HK3P52790 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HK3P52790 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HK3P52790 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HK3P52790 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HK3P52790 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HK3P52790 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HK3P52790 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HK3P52790 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HK3P52790 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HK3P52790 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HK3P52790 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HK3P52790 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HK3P52790 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HK3P52790 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HK3P52790 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HK3P52790 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HK3P52790 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HK3P52790 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HK3P52790 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HK3P52790 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HK3P52790 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HK3P52790 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HK3P52790 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HK3P52790 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HK3P52790 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HK3P52790 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HK3P52790 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HK3P52790 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HK3P52790 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HK3P52790 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HK3P52790 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HK3P52790 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HK3P52790 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HK3P52790 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HK3P52790 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HK3P52790 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HK3P52790 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HK3P52790 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HK3P52790 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HK3P52790 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HK3P52790 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HK3P52790 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms