Protein–RNA interactions for Protein: P51812

RPS6KA3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3P51812 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA3P51812 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA3P51812 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA3P51812 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA3P51812 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA3P51812 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA3P51812 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA3P51812 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA3P51812 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA3P51812 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA3P51812 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KA3P51812 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KA3P51812 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KA3P51812 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KA3P51812 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KA3P51812 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA3P51812 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA3P51812 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KA3P51812 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA3P51812 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA3P51812 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA3P51812 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA3P51812 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPS6KA3P51812 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KA3P51812 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA3P51812 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA3P51812 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA3P51812 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA3P51812 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KA3P51812 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KA3P51812 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KA3P51812 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KA3P51812 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KA3P51812 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KA3P51812 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KA3P51812 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KA3P51812 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KA3P51812 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KA3P51812 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KA3P51812 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS6KA3P51812 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms