Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNA3P51805 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNA3P51805 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNA3P51805 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNA3P51805 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNA3P51805 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNA3P51805 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLXNA3P51805 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLXNA3P51805 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PLXNA3P51805 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNA3P51805 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNA3P51805 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNA3P51805 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNA3P51805 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNA3P51805 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNA3P51805 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNA3P51805 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNA3P51805 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNA3P51805 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNA3P51805 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNA3P51805 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXNA3P51805 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXNA3P51805 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLXNA3P51805 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLXNA3P51805 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLXNA3P51805 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLXNA3P51805 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLXNA3P51805 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLXNA3P51805 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNA3P51805 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNA3P51805 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNA3P51805 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNA3P51805 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNA3P51805 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNA3P51805 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNA3P51805 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNA3P51805 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNA3P51805 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNA3P51805 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNA3P51805 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNA3P51805 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNA3P51805 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNA3P51805 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNA3P51805 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNA3P51805 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PLXNA3P51805 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLXNA3P51805 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLXNA3P51805 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLXNA3P51805 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLXNA3P51805 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLXNA3P51805 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLXNA3P51805 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLXNA3P51805 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLXNA3P51805 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLXNA3P51805 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLXNA3P51805 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLXNA3P51805 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLXNA3P51805 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLXNA3P51805 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLXNA3P51805 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLXNA3P51805 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLXNA3P51805 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PLXNA3P51805 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLXNA3P51805 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLXNA3P51805 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PLXNA3P51805 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLXNA3P51805 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLXNA3P51805 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLXNA3P51805 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLXNA3P51805 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLXNA3P51805 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLXNA3P51805 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLXNA3P51805 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLXNA3P51805 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLXNA3P51805 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLXNA3P51805 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLXNA3P51805 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLXNA3P51805 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLXNA3P51805 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNA3P51805 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNA3P51805 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNA3P51805 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNA3P51805 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNA3P51805 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXNA3P51805 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms